进境动植物检疫许可证审批采取电子方式。（1）首次申请办理进境动植物检疫许可证的需要进行用户注册，用户注册完成以后，可以登录进境动植物检疫许可证申请系统，在系统内向直属检验检疫局递交申请。（2）然后将纸质材料递交直属检验检疫局，负责受理申请的直属检验检疫局在收到书面材料后进行审核，符合法定形式的正式受理申请，直属局审核合格后，在系统内递交国家质检总局。（3）总局终审，作出行政许可决定或者不予许可决定。（4）总局作出行政许可决定之后，直属检验检疫局打印证书。
进境动植物检疫许可证审批采取电子方式。（1）首次申请办理进境动植物检疫许可证的需要进行用户注册，用户注册完成以后，可以登录进境动植物检疫许可证申请系统，在系统内向直属检验检疫局递交申请。（2）然后将纸质材料递交直属检验检疫局，负责受理申请的直属检验检疫局在收到书面材料后进行审核，符合法定形式的正式受理申请，直属局审核合格后，在系统内递交国家质检总局。（3）总局终审，作出行政许可决定或者不予许可决定。（4）总局作出行政许可决定之后，直属检验检疫局打印证书。